Зачем нужен ПЦР-бокс

Полимеразная цепная реакция многократно копирует участок ДНК. Именно поэтому она так чувствительна к загрязнению: если в пробирку попадёт следовое количество ДНК из воздуха, с перчатки или со стола, оно размножится наравне с целевой матрицей и даст результат, которого нет.

Самый опасный источник — не пыль и не микроорганизмы, а ампликоны: продукты уже проведённых реакций. Их концентрация после амплификации огромна, они переносятся аэрозолем при открывании пробирок и оседают на поверхностях. Обычная уборка их не снимает. Отсюда и конструкция ПЦР-бокса: фильтрация воздуха плюс обязательное УФ-обеззараживание рабочей зоны между сериями.

Ключевое отличие от ламинара. Ламинарный шкаф борется с микробным загрязнением и поддерживает стерильность. ПЦР-бокс борется с молекулярным загрязнением — остаточной ДНК. Это разные задачи, и штатный УФ-таймер есть именно у ПЦР-бокса.

Откуда берётся загрязнение пробы

Понимание источников объясняет и конструкцию бокса, и правила работы в нём.

Аэрозоль при открывании пробирок. Когда крышку срывают, над пробиркой образуется мелкодисперсное облако. После амплификации концентрация ДНК в нём огромна, и это главный путь переноса ампликонов.

Поверхности. Ампликоны оседают на столе, стенках, штативах, корпусах дозаторов. Обычная влажная уборка снимает видимые загрязнения, но не гарантирует разрушения ДНК — для этого и нужен ультрафиолет.

Расходные материалы и перчатки. Наконечник, которым касались загрязнённой поверхности, переносит ДНК в реакционную смесь. Отсюда требование к наконечникам с фильтром и к смене перчаток между зонами.

Воздух помещения. Пыль несёт на себе биологический материал. Этот путь закрывает HEPA-фильтрация входящего потока во время работы.

Конструкция ПЦР-бокса отвечает ровно на два последних пункта: фильтр работает во время операции, ультрафиолет — между операциями. Первые два закрываются дисциплиной работы, и никакое оборудование их не отменяет.

Как ещё называют это оборудование

В каталогах, тендерной документации и обиходе встречаются: ПЦР-бокс, бокс абактериальной воздушной среды (БАВ), абактериальный бокс, БАВС, «бокс для ПЦР-диагностики», «УФ-бокс для ПЦР». Всё это одно и то же оборудование.

Порядок слов в заявке при этом гуляет как угодно: ПЦР УФ-бокс, бокс лабораторный для ПЦР, бокс лабораторный с ПЦР-диагностикой, ПЦР-шкаф, бокс абактериальной воздушной среды, ПЦР-бокс — речь всегда об одной и той же машине. Отдельно стоит канцелярская связка бокс абактериальной ПЦР-диагностики: она встречается в тендерах и означает ровно то же. Там же попадается вариант с рассогласованием — бокс абактериальный воздушной среды, БАВ; это не другой прибор, а описка, кочующая из документа в документ. Встречаются и ламинарные боксы для ПЦР — название неточное, но ищут им именно ПЦР-боксы.

Сочетания вида БАВС с числом — уже модельные обозначения конкретных производителей, и число в них обычно означает ширину рабочей зоны в миллиметрах. Подбирать по такому шифру напрямую нельзя: у разных производителей литеры значат разное. Смотреть нужно на ширину, класс фильтра и наличие УФ с таймером.

Как устроен ПЦР-бокс

Фильтрация входящего воздуха

Воздух проходит два рубежа: моющийся предфильтр из полиэстера, который снимает крупную пыль и продлевает ресурс основного фильтра, и HEPA-фильтр класса H14 с эффективностью 99,995 % по частицам 0,3 мкм. Очищенный воздух подаётся в рабочую зону сверху вниз ламинарным потоком: 0,3–0,5 м/с в серии ПЦР и 0,2–0,5 м/с в ПЦР-С, с многоступенчатой регулировкой.

В серии ПЦР-С рабочая зона дополнительно нормирована по чистоте — ISO 5 (класс 100), а задняя стенка выполнена с перфорацией, чтобы в углах не образовывались застойные зоны.

УФ-обеззараживание поверхностей

Лампа с длиной волны 253,7 нм разрушает ДНК на поверхностях рабочей зоны. Мощность подбирается под ширину бокса: от 8 Вт в компактном исполнении до 40 Вт в широком, в самых больших моделях ставятся две лампы. Работает по таймеру: в серии ПЦР диапазон 0–90 минут, в ПЦР-С таймер программируемый, до 999 минут — цикл можно поставить на ночь.

УФ-лампа блокируется при открытом фронтальном окне, а стекло имеет УФ-защиту. Облучение оператора исключено конструктивно, а не инструкцией.

Отдельный вопрос — ПЦР-бокс с УФ-рециркулятором. Это разные приборы, и одно другого не заменяет. Рециркулятор обеззараживает воздух помещения, прогоняя его через закрытую камеру с лампой, и потому работает при людях. В боксе лампа облучает поверхности рабочей зоны напрямую, поэтому включается только в закрытом боксе и без оператора. Рециркулятор не обеззаразит столешницу бокса, а бокс не почистит воздух в комнате.

Рабочая зона и оснащение

Фронтальное стекло закалённое, 5 мм, с УФ-защитой. В серии ПЦР подъём моторизованный у большинства моделей, в ПЦР-С — ручное сдвижное. Внутри: светодиодное освещение, две влагозащищённые розетки IP54 (в серии ПЦР с общей нагрузкой 500 Вт), полка с опорной штангой из нержавеющей стали, столешница AISI 304. Корпус на колёсной базе с фиксаторами.

Чем ПЦР-бокс отличается от соседнего оборудования

Четыре типа шкафов выглядят похоже — стекло, рабочая зона, вентилятор. Разница в том, кого они защищают.

Отсюда и запросы вида ламинарный бокс ПЦР или ламинарный шкаф ПЦР-бокс: оборудование ищут, называя его соседним типом. Ошибка не безобидная — ламинар и ПЦР-бокс защищают разное, и подмена стоит лаборатории результатов, а не денег.

ОборудованиеКого защищаетТиповая задачаКак устроена защита
ПЦР-бокс (БАВ)Только пробуПостановка ПЦР, выделение нуклеиновых кислот, подготовка библиотекHEPA H14 на притоке + УФ-обеззараживание зоны по таймеру
Ламинарный шкафТолько образецКультура клеток, приготовление стерильных растворовHEPA на притоке, УФ штатно не предусмотрен
Бокс микробиологической безопасностиОператора, образец и средуПатогенные микроорганизмы, инфицированный материалHEPA на притоке и на вытяжке, защитный воздушный барьер
Вытяжной шкафОператора и помещениеЛетучие токсичные и едкие веществаОтвод воздуха из зоны наружу или фильтрация

Отсюда практические запреты. В ламинаре нельзя ставить ПЦР как регулярную работу: нет обеззараживания зоны по таймеру, ампликоны накапливаются. В вытяжном шкафу нельзя по другой причине — воздух идёт из помещения внутрь, и проба стоит в потоке нефильтрованного лабораторного воздуха.

Зонирование ПЦР-лаборатории

Рабочие зоны в ПЦР-лаборатории разделяют не ради формальности: проба и ампликон не должны встречаться ни в воздухе, ни на руках оператора.

Работа с ПЦР традиционно разносится по зонам: подготовка проб, приготовление реакционной смеси, амплификация и детекция. Смысл разделения тот же, что и у самого бокса — не дать ампликонам из зоны детекции попасть туда, где работают с исходным материалом. Поэтому боксы ставят в разные помещения или разные зоны, а не используют один на весь цикл.

Сколько боксов нужно конкретной лаборатории, зависит от принятой схемы и потока проб. Типовой минимум — отдельный бокс на зону подготовки смеси, где требования к чистоте самые жёсткие.

Движение материалов в такой схеме однонаправленное: от зоны подготовки проб к зоне детекции, и никогда обратно. Это же правило распространяется на людей, халаты, дозаторы и штативы — у каждой зоны свой комплект, который из неё не выносят. Бокс здесь закрывает самое узкое место: момент, когда пробирки открыты и проба контактирует с воздухом помещения.

Поэтому ширину бокса в зоне подготовки смеси обычно берут с запасом: туда ставят штативы, дозаторы и охлаждающие блоки, и всё это должно помещаться одновременно, не заставляя выносить часть оснастки за пределы чистой зоны.

Чего нельзя делать в ПЦР-боксе

Ошибки эксплуатации обесценивают оборудование быстрее, чем износ.

Работать с инфекционным материалом. Воздух из рабочей зоны выходит в помещение без очистки на вытяжке — оператор и лаборатория не защищены. Для патогенов нужен бокс микробиологической безопасности.

Ставить открытые пробирки с ампликонами. Зона детекции и зона приготовления смеси не должны пересекаться даже в одном боксе. Если в бокс занесли продукт амплификации, дальше он будет находиться там же, где готовят новые реакции.

Хранить в зоне лишнее. Коробки, штативы «про запас» и бумага нарушают ламинарность потока и создают тень для ультрафиолета: поверхность под предметом не обрабатывается.

Полагаться только на УФ. Ультрафиолет действует на прямой видимости и не проникает под предметы и в щели. Перед включением лампы зону освобождают и протирают.

Обслуживание: что и когда меняют

Предфильтр из полиэстера моющийся — его снимают, промывают и ставят обратно по регламенту лаборатории. Именно он принимает на себя крупную пыль и продлевает ресурс основного фильтра.

HEPA-фильтр H14 меняют не по календарю, а по факту: по мере забивания растёт сопротивление и падает скорость потока. В серии ПЦР-С за этим следит штатный датчик скорости потока — падение ниже рабочего диапазона и есть сигнал к замене. В серии ПЦР скорость контролируется по показаниям панели и многоступенчатой регулировке.

УФ-лампа имеет ограниченный ресурс излучения: она продолжает светиться заметно дольше, чем сохраняет обеззараживающую способность на длине волны 253,7 нм. Поэтому лампу меняют по наработке, указанной изготовителем лампы, а не «пока горит». Наработку удобно вести по таймеру: в ПЦР-С он программируемый, и цикл фиксирован.

Модели в каталоге

Две серии, 10 моделей шириной 800–1900 мм. Характеристики и выбор типоразмера — в карточках; поэтапный разбор параметров с таблицей всех моделей — в статье «Как выбрать ПЦР-бокс».

Kadamm ПЦР
ПЦР
ПЦР
5 моделей
Моторизованный подъём окна у большинства моделей, ЖК-панель, таймер УФ до 90 минут. Ширина 800–1500 мм.
Открыть
Kadamm ПЦР-С
ПЦР-С
ПЦР-С
5 моделей
Сенсорная панель, датчики температуры и скорости потока, таймер до 999 минут, класс ISO 5. Ширина 800–1900 мм.
Открыть